IXThinker·2026-11-01 22:20

17 種 AI 藥物生成模型系統評測

2026年10月1日，同濟大學、中國科學院上海藥物研究所、上海科技大學及臨港實驗室的研究團隊在《Nature Communications》發表論文，系統評估生成式模型於結構基礎藥物發現中的表現，為 AI 驅動的藥物研發建立方法論基準。

評測基準設計

研究構建綜合評測基準 MolGenBench，涵蓋 120 個蛋白質靶點與 600 個化合物系列，比較 17 種代表性分子生成方法。評測覆蓋從頭分子設計，以及由苗頭化合物推進至先導化合物的 Hit-to-Lead（H2L）兩個關鍵階段。

團隊整合有效性、新穎性、合成可行性與靶標結合精度等多維度指標，建立統一評估框架，用以對比主流 AI 生成模型的性能差異，並揭示各類方法在不同設計環節的優勢與局限。

結果顯示，現有模型在構象生成與局部優化環節表現較好，但在長程相互作用建模與多靶點協同設計上仍面臨挑戰。團隊認為，這項工作可為 AI 驅動的藥物研發提供方法論基準與實踐指引，協助研究者按需求選用合適的生成模型。