微軟研究院發布生物分子基礎模型BioEmu2
微軟研究院推出第二代生物分子基礎模型BioEmu2,將靜態結構預測與動態過程建模納入同一框架,針對傳統折疊模型只能輸出單一構象、分子動力學模擬算力成本高昂的矛盾提出新方案。
技術矛盾
以AlphaFold為代表的折疊模型能夠高精度預測蛋白質結構,但輸出多是尖銳單一的靜態快照,難以反映分子在生理環境下持續變化的柔性狀態。
若改用全原子分子動力學模擬捕捉動態,則需消耗大量GPU算力,完整刻畫一個過程往往要數周甚至數年,限制了大規模科研應用的空間。


模型定位
BioEmu2由微軟研究院AI for Science團隊開發,由科學家Frank Noé領銜,定位為全面進化的第二代生物分子基礎模型。
有別於傳統的分子動力學模擬或單純的結構預測模型,它同時承擔靜態結構預測與動態行為刻畫兩類任務,試圖以單一模型統一兩種視角。


應用價值
蛋白質的構象集合對藥物設計至關重要,靶點的可結合位點往往只出現在部分構象之中,動態建模能力直接影響虛擬篩選與藥物評估的準確度。
若精度與效率得以並存,計算醫藥研究便能以更低成本理解分子行為,加快從結構解析走向功能預測的完整研究流程,惠及相關藥物開發。


