LigandMPNN 精準設計含配體的蛋白質序列
在小分子、核苷酸與金屬離子等配體環境下設計蛋白質序列,對酶、配體結合蛋白及生物傳感器開發至關重要。Baker 團隊提出 LigandMPNN,可顯式建模所有非蛋白組分,性能大幅領先。
難題所在
現有基於深度學習的蛋白質序列設計方法,難以有效建模小分子、核苷酸和金屬離子等非蛋白組分,而這些組分恰恰決定酶催化、配體結合與傳感器功能,是相關研究繞不開的環節。


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