CauTrigger框架辨識生物因果驅動因子
生物系統的狀態轉變受多層次調控網絡影響,傳統組學分析偏重統計相關性,難以區分真正的因果驅動因素。研究人員提出名為CauTrigger的層次化因果分解框架,結合因果推斷與深度潛在變量建模,為這一問題提供可解釋的解析工具。
研究背景
生物系統的狀態轉變通常受到多層次調控網絡的共同影響,不同分子之間通過複雜的級聯作用,決定着細胞命運、疾病進展及機體表型的走向。
傳統組學分析主要關注統計相關性,難以區分真正驅動狀態變化的因果因素,與只是伴隨出現的非因果信號,從而影響機制研究的可靠性。


方法設計
CauTrigger融合因果推斷與深度潛在變量建模,通過整合do-calculus干預理論,將觀測數據中的潛在因果因素與虛假關聯因素分離。
框架其後逐層遞歸重建不同調控層次之間的因果關係,從而識別潛在的狀態轉變驅動因子,並對系統在受到擾動時的響應作出預測,形成完整的解析流程。


驗證與應用
在多種模擬數據及真實生物學數據中,CauTrigger於因果觸發因子識別及系統響應預測兩方面均接受檢驗,結果顯示方法在該兩項任務上具有可用性。
框架面向疾病進展、細胞命運等關鍵生物學過程,提供可解釋的因果解析,有助提升靶點發現與機制理解的可靠性,為因果與伴隨信號的區分提供工具。


