GPU加速MMseqs2 蛋白同源搜索快6倍
蛋白質數據庫規模快速膨脹,對更快、更靈敏的同源搜索工具需求迫切。研究人員開發的GPU加速版MMseqs2-GPU大幅提速結構預測與比對任務,成果已開源供全球科研人員使用。
同源搜索之要
蛋白質同源搜索是理解蛋白質功能與結構的核心環節,傳統工具隨着數據庫增長愈來愈吃力。研究人員為MMseqs2開發GPU加速版本,在單一蛋白搜索中比基於128核CPU的方法快6倍,大規模批量任務亦有明顯優勢。

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