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IXThinker·2026-04-13 17:20

擴散模型新框架攻克柔性口袋分子設計

研究生命科學

結構基礎藥物設計中,柔性蛋白口袋的分子設計因蛋白構象變化而極具挑戰,現有深度學習方法多將口袋視為剛性。研究人員提出新擴散模型框架,首次實現口袋結構與配體構象的聯合建模,令柔性口袋分子設計真正可行。

剛性假設的局限

蛋白在與配體結合過程中往往發生構象變化,但近年主流的深度學習分子生成方法,大多仍把蛋白口袋當作固定不變的剛性結構處理,無法準確刻劃蛋白與配體相互作用的動態特性,令設計結果與真實結合情況存在偏差。

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