新系統挖掘蛋白質宇宙 識別環狀置換
結構預測工具已把可用蛋白質結構擴展至數億規模,但主流結構搜尋依賴端到端的線性順序比對,容易遺漏環狀置換這類特殊同源關係。新研究提出具置換不變性的圖神經網絡,專門補上這一盲區。
何謂環狀置換
環狀置換指兩種蛋白質的三維摺疊高度相似,但N端與C端的位置循環重排。傳統順序比對按線性對應,遇上這種循環重排,便難以確認兩者的同源關係。


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