IXThinker·2025-01-09 18:50

新基因型表示圖GRG 大幅壓縮全基因組數據

康奈爾大學計算生物學系團隊在Nature Computational Science發表基因型表示圖（GRG）：這種層次化數據結構能無損編碼全基因組多態性，將20萬個人類基因組壓縮至每條染色體5至26GB。

存儲困境

對大量基因組進行計算分析，需要一種既能緊湊表示數據集、又能對變異和樣本進行高效操作的數據結構。現有的表格數據結構和文件格式對遺傳數據的編碼，已變得既昂貴又不可持續。