IXThinker·2025-02-18 13:10

深度學習設計增強子 TFBU概念新提出

發表於《自然·通訊》的研究提出轉錄因子結合單元（TFBU）概念，以模組化方式建模增強子，並用深度學習定量分析周邊序列的影響，據此開發出增強子設計工具包DeepTFBU。

背景知識

增強子透過與轉錄因子（TF）相互作用，成為基因表達的關鍵調控元件。轉錄因子結合位點（TFBS）普遍被視為決定TF結合與增強子活性的關鍵，但其周邊上下文序列的影響此前一直未被量化。