劍橋Celcomen模型 空間轉錄組學因果推斷
細胞的基因表達譜同時編碼內在特性與外在微環境資訊,解開兩者的因果關係對理解細胞間相互作用至關重要。劍橋大學團隊提出虛擬組織模型Celcomen,首次實現因果推斷可識別性,成果入選ICLR 2025。
問題背景
在生物學中,細胞的基因表達既反映自身內在特性,也受所處組織微環境影響。隨著空間轉錄組學發展,研究人員可在單細胞分辨率下同時測定基因表達與空間座標,並大規模開展基因敲除等擾動實驗。
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