低秩張量補全算法重建單細胞3D染色質結構
染色體的動態三維構象在單細胞層面存在複雜結構變異,對轉錄與表觀遺傳調控舉足輕重。密歇根州立大學Jianrong Wang團隊提出新算法Tensor-FLAMINGO,破解單細胞染色質數據高比例缺失的難題。
難題:接觸缺失
單細胞染色質接觸圖譜中存在高比例的缺失接觸,為重建高分辨率空間染色質構象帶來重大挑戰。染色體三維構象的變異,深刻影響單細胞特異性的轉錄與表觀遺傳景觀,重建工作意義重大。


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