STCase以圖神經網絡解析 單細胞層面細胞通訊
細胞間通訊(CCC)是生物系統協調運作的基礎,研究人員開發出STCase工具,結合空間轉錄組數據與可解釋的多視圖圖神經網絡,在單細胞層面解析通訊機制,成果刊於《自然·計算科學》。
為何需要STCase
越來越多證據顯示,同一類型的細胞在不同微環境中會呈現差異化的互作模式,但現有方法多在細胞類型或簇群層面推斷CCC,忽略了微環境異質性,難以捕捉精細差異。

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