MEMnets捕捉蛋白慢運動 解析生物分子動力學
準確捕捉蛋白質構象變化最慢時間尺度的集體變量(CV),對理解生物過程至關重要。研究人員提出基於記憶核最小化的神經網絡MEMnets,為解析生物分子最慢運動模式提供新工具。
慢運動之難
蛋白質構象變化橫跨多個時間尺度,其中最慢的集體變量往往決定關鍵生物過程。傳統方法常假設動力學為馬爾可夫過程,但真實分子動力學帶有非馬爾可夫的記憶效應,令慢速CV的識別困難重重。


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