新指標GTE逐基因量化單細胞批次效應
發表於Nature Computational Science的研究提出新指標GTE,逐基因量化單細胞數據中的批次效應,發現少數高敏感基因在此中起主導作用,為更精準地識別與校正批次效應提供新思路。
問題背景
批次效應顯著干擾多個單細胞實驗之間的比較,而現有的批次效應去除與量化方法,主要關注跨批次的細胞對齐,往往忽略了基因層面的批次效應影響。

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