DeepTCR框架拓展免疫學研究手段
T細胞受體測序(TCR-Seq)是次世代測序技術的重要應用,能系統描述適應性免疫反應的多樣性。針對傳統方法難以捕捉低頻訊號的局限,深度學習框架DeepTCR以卷積神經網絡對TCR序列作更精細的特徵化,拓展了免疫學研究手段。
傳統方法的局限
基序搜尋、序列比對等傳統方法在解析TCR數據時逐漸暴露局限:體內低頻率的抗原特異性T細胞反應,訊號常被大量非特異性T細胞的背景淹沒,從雜訊中識別訊號是長期難題。


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