SE(3)擴散模型生成蛋白動力學軌跡 採樣效率大增
研究人員在《J. Chem. Inf. Model.》發表蛋白軌跡擴散模型PTraj-Diff,以幾何擴散機制從噪聲中重建蛋白及複合物的動力學軌跡,大幅提升構象採樣的效率與準確度。
蛋白動態研究難題
蛋白質及其複合物的構象動態,在生物功能之中發揮著關鍵的作用,然而傳統分子動力學模擬要探索這些動態,計算成本極為高昂。
增強採樣方法雖然已經有所改進,但依然受制於極其龐大的構象空間,難以完整覆蓋蛋白在功能過程之中的各個關鍵狀態轉換。


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