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IXThinker·2026-02-22 21:40

TiRank框架整合單細胞與空間轉錄組 助識別腫瘤生態位

研究醫療 AI

研究人員在《Genome Medicine》提出TiRank計算框架,整合單細胞測序、空間轉錄組與臨床表型數據,構建統一嵌入空間以優先識別臨床相關的空間生態位,在多癌種驗證中表現精準。

腫瘤研究背景

腫瘤微環境的細胞組成與空間組織,深刻影響癌症的發生發展與治療反應。然而如何從海量組學數據中定位與臨床結局相關的特定空間結構,一直是精準腫瘤學的難點。

單細胞RNA測序揭示細胞類型,空間轉錄組提供位置資訊,批量轉錄組則攜帶臨床表型,三類數據各自豐富卻彼此割裂,業界長期缺乏統一的整合分析框架。

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