圖神經網絡框架預測基因組抗菌耐藥性
抗菌藥物耐藥性是全球公共衛生難題,全基因組測序數據蘊藏解讀線索。研究人員提出圖深度學習框架AMR-GNN,整合多種基因組表示,直接從序列預測耐藥表型,以銅綠假單胞菌驗證成效。
研究背景
全基因組測序數據為解析抗菌藥物耐藥性的分子機制提供重要資源,但這類數據特徵維度高,且缺乏統一的基因組表示方式,成為利用機器學習預測耐藥表型的主要障礙。


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