結構比對驅動跨圖建模 破解功能性RNA設計難題
發表於頂級計算科學期刊的研究提出RNA逆向設計框架AlignIF。方法借鑑蛋白質結構預測中多序列比對的思想,把多個結構相似的RNA進行多結構比對,再以跨圖注意力捕捉共享的模式與進化約束,緩解數據稀缺。
RNA設計的數據瓶頸
RNA廣泛參與蛋白質合成、基因表達調控、分子識別與生物催化,其功能通常取決於特定三維折疊。惟RNA柔性高、構象不穩定,可用於訓練的高質量三維結構遠少於蛋白質,模型易過擬合,對新型折疊的泛化能力不足。


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