Baker組新方法 以全原子模型釋放逆向設計潛力
人工智能正在模糊蛋白質結構預測與分子設計的邊界。Baker團隊的RFOptimization工作指出,儲存在全原子模型內部的隱含物理知識,不僅可用於由序列推結構,更可反向用於分子操控,由目標功能反推最優序列。
從正向預測到逆向設計
AlphaFold、Boltz、Protenix與RoseTTAFold等結構模型,已從海量生物分子數據中學會了氨基酸序列、三維結構、原子幾何與分子相互作用之間的複雜對應關係。關係之複雜前所未見。
過去這些知識主要用於回答正向問題:給定分子序列,會折疊成什麼結構?但一個自然的追問隨之而來:模型內部高度壓縮的分子世界表徵,是否只能用來預測?

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