語言模型自學序列先驗 助推基因調控網絡推斷
基因調控網絡刻劃轉錄因子與靶基因的調控關係,對理解細胞狀態與命運至關重要。僅憑測序數據推斷的不確定性偏高,多需人工整理的先驗網絡引導。新研究讓語言模型直接從序列學習調控先驗,惠及研究不足的物種。
先驗網絡成瓶頸
基因調控網絡刻劃轉錄因子如何調控靶基因,對理解細胞狀態與命運至關重要。然而僅靠表達相關性反推,結果不確定性高,因此多數方法需要先驗網絡指明哪些調控組合更可能真實存在。


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